Choroba ta jest wynikiem wrodzonych błędów genetycznych. Mutacje dotyczą zazwyczaj genów kodujących białka strukturalne skóry, takie jak keratyny. Keratyny odpowiadają za wytrzymałość i integralność naskórka. Nieprawidłowa budowa tych białek sprawia, że komórki skóry dzielą się nadmiernie lub nie złuszczają się prawidłowo, co prowadzi do akumulacji masy rogowej.
Mimo że genetycznego rogowca podeszwowego nie można wyleczyć przyczynowo, możliwe jest skuteczne łagodzenie objawów poprzez regularną pielęgnację (zabiegi u podologa), stosowanie maści keratolitycznych z mocznikiem lub kwasami AHA, a w cięższych przypadkach – leczenie doustne retinoidami